Une étude récente suggère que la consommation d’aliments riches en « bonnes » bactéries produisant certains métabolites pourrait améliorer le bien-être psychique en exerçant une influence sur le microbiote intestinal.
La fermentation est un procédé ancestral, utilisé depuis des millénaires pour conserver les aliments ou pour améliorer leur digestibilité.
Elle repose sur l’action de micro-organismes vivants, comme les bactéries lactiques ou les levures, qui transforment naturellement les sucres et d'autres composés organiques présents dans les aliments.
Ce processus naturel modifie non seulement la texture et la saveur de l'aliment, mais aussi sa composition nutritionnelle et la disponibilité de certains nutriments.
Entre autres bénéfices, lorsqu’un aliment subit une fermentation, il s’enrichit naturellement en levures et bactéries probiotiques actives (1).
Étudiés depuis de nombreuses années, les probiotiques sont des micro-organismes vivants qui ont la capacité de soutenir l'équilibre du microbiote intestinal.
En effet, les probiotiques aident à préserver la diversité bactérienne au sein du côlon, un élément qui joue un rôle dans le bon fonctionnement de la digestion ainsi que dans divers processus du corps humain (2).
On retrouve ces micro-organismes dans divers aliments fermentés : yaourts, fromage, kéfir, miso, légumes lactofermentés (choucroute, kimchi, etc.) et bien d'autres encore.
On peut aussi les consommer sous forme de compléments alimentaires en poudre ou en gélules.
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Du fait de l'influence du microbiote digestif sur l'organisme en général, de nombreuses recherches explorent aujourd’hui le rôle des probiotiques dans divers domaines, y compris celui de la santé mentale.
C'est ainsi que les chercheurs ont dévoilé il y a quelques années l'existence de l’axe intestin-cerveau (3), un réseau de communication bidirectionnel entre le système digestif et le système nerveux central.
Une équipe de chercheurs a publié en février 2025 une étude dans la revue EMBO Molecular Medicine portant sur les liens entre le microbiote intestinal et les comportements anxieux (4).
Leurs travaux se sont appuyés sur l'observation de souris sans microbiote intestinal et élevées sans microbes.
Ces dernières présentaient des comportements plus anxieux. Elles montraient également une hyperactivité neuronale dans une région bien précise du cerveau : l’amygdale basolatérale, impliquée dans la gestion des émotions et du stress.
Ces mêmes souris ont ensuite été mises en contact avec des micro-organismes vivants afin de développer un microbiote normal. D'autres ont été supplémentées avec un métabolite produit par les bactéries intestinales, l’indole.
Dans les deux cas, les comportements anxieux ont nettement diminué.
Les chercheurs expliquent ce phénomène par le fait que l’indole, dérivé du tryptophane (un acide aminé présent dans de nombreux aliments fermentés), agirait comme une molécule messagère entre l’intestin et le cerveau.
En traversant la barrière hématoencéphalique, elle pourrait ainsi réguler l’activité neuronale dans des zones impliquées dans les émotions, comme l’amygdale.
Ces observations soutiennent l’idée que les métabolites issus du microbiote intestinal influencent directement certaines fonctions cérébrales liées au stress et à l’anxiété.
Ainsi, selon cette étude, maintenir un microbiote équilibré, par le biais d'une alimentation comprenant la consommation d’aliments fermentés riches en bactéries productrices d’indole, pourrait aider à conserver un bon équilibre émotionnel.
Ces résultats, bien que prometteurs, restent toutefois à interpréter avec précaution, car ils ne concernent pour le moment que des modèles animaux.
Des recherches complémentaires sont nécessaires pour confirmer ces mécanismes chez l’être humain.
L’étude publiée dans le journal EMBO n’est pas la seule à s'être penchée sur les interactions entre le microbiote intestinal et la sphère psychique.
Ce domaine, que l'on appelle parfois psychobiotique, explore la manière dont les micro-organismes intestinaux peuvent influencer le comportement, les émotions et la cognition.
Une étude de 2021 a notamment montré qu’un microbiote diversifié est associé à une meilleure régulation émotionnelle et à une réduction des symptômes dépressifs (5).
Dans le même ordre d'idée, des chercheurs de l’Université de Cork ont mis en évidence que certaines souches de Lactobacillus et de Bifidobacterium peuvent moduler la réponse au stress chez l’animal comme chez l’humain (6).
Certaines études se sont, quant à elles, penchées sur la capacité des probiotiques à influencer la production de neurotransmetteurs ou à moduler l'activité du cerveau.
Ces résultats renforcent l’idée que la santé mentale ne se limite pas à la zone cérébrale : elle dépend aussi en partie de la santé intestinale.
C’est pourquoi la communauté médicale recommande aujourd'hui d'avoir une alimentation équilibrée, tant pour la santé physique que pour l'équilibre psychique.
À l’heure actuelle, il existe même des formules probiotiques conçues avec des souches minutieusement sélectionnées dans la perspective d’agir sur les voies de communication entre intestin et système nerveux.
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