Des banques de selles géantes pour archiver nos microorganismes intestinaux ?

Biobanques de selles : un phénomène qui monte

Imaginez une immense bibliothèque dont les étagères seraient remplies… d’échantillons de selles. Cette vision vous paraît saugrenue ?

Elle ne choque pas en tout cas les microbiologistes, de plus en plus obsédés par l’archivage massif de nos excréments dans de gigantesques biobanques.

Pour preuve, les projets visant à recueillir nos matières fécales ne cessent de se multiplier à travers le monde.

Déjà en 2008, le Human Microbiome Project (HMP) initié par les National Institutes of Health américains avait collecté divers échantillons biologiques de plus de 200 volontaires.

Onze ans plus tard, le Million Microbiome of Humans Project (MMHP) lui emboîte le pas avec un objectif très ambitieux : prélever 1 million d’échantillons microbiens humains, et notamment des matières fécales, à travers différents pays et continents en vue de constituer la plus grande base de données mondiale.

À noter que des initiatives similaires se sont aussi développées à l’échelle nationale, comme American Gut aux États-Unis (2012), Chinese Gut en Chine (2017) ou encore plus récemment French Gut en France (2022).

Collecte des excréments humains : une manière d’archiver nos microorganismes intestinaux

Mais pourquoi un tel engouement autour de nos excréments ?

Parce qu’à travers cette manœuvre, les chercheurs espèrent collecter, analyser et conserver les milliards de microorganismes intestinaux qui colonisent le tractus humain.

Dans le détail, plusieurs motivations scientifiques sont invoquées :

• préserver la diversité microbienne. Le passage à une alimentation transformée et la systématisation des antibiotiques a altéré au fil des siècles la diversité de notre microbiote (1). Or, l’extinction de certaines souches bénéfiques qui n'auraient pas encore été identifiées comme telles (ni isolées, donc) constituerait une menace sérieuse pour notre santé. Leur archivage permet au moins de les conserver en lieu sûr en vue de les exploiter ultérieurement, par exemple pour traiter certaines affections actuelles ou futures ;
• étudier l'impact du microbiote sur la santé humaine. Une meilleure compréhension de notre microbiote ouvrirait la voie à de nouvelles stratégies thérapeutiques contre des maladies inflammatoires ou chroniques non transmissibles : obésité, diabète de type 2, asthme… (2-4) ;
• développer de nouveaux probiotiques et prébiotiques. Une cartographie poussée des microbiomes humains aiderait à répertorier les souches bactériennes exerçant des effets positifs sur la santé, et par extension à concevoir de nouvelles générations de probiotiques (les microorganismes vivants eux-mêmes), de prébiotiques (qui leur servent de nourriture et soutiennent leur implantation) ou de postbiotiques (les métabolites produits par les bactéries intestinales, qui intéressent de plus en plus la communauté scientifique) ;
• personnaliser les traitements et supplémentations. Mieux identifier et interpréter les variations dans la composition du microbiome humain servirait potentiellement de tremplin aux thérapies personnalisées (régime alimentaire, médicaments, compléments alimentaires…).

Des probiotiques et postbiotiques à la pointe du combat

La gamme des pro- et postbiotiques s’élargit d’année en année pour cibler des problématiques toujours plus précises.

Dans le domaine de la vision par exemple, la forme inactivée de Lacticaseibacillus paracasei a beaucoup fait parler d’elle. Des travaux suggèrent notamment qu’elle pourrait moduler les réactions inflammatoires induites par la fatigue visuelle en stimulant les cellules immunitaires de l’œil (le complément Vision PostBiotic s’appuie sur la souche propriétaire postbiotique Lacticaseibacillus paracasei KW3110, soutenue par des études scientifiques in vitro et in vivo) (5).

Autre cheval de bataille des « biotiques », la lutte contre la bactérie antibiorésistante Helicobacter pylori, à l’origine de près de 80 % des ulcères gastro-duodénaux. Les chercheurs sont parvenus à isoler une souche inactivée de Lactobacillus reuteri nommée DMS 17648 capable de se co-agréger avec le pathogène pour faciliter son expulsion via le tube digestif (à retrouver dans H. Pylori Formula, ou dans sa version avancée H. Pylori Formula Advanced Formula) (6).

Le champ de la minceur profite aussi de ces prodigieuses avancées. Plusieurs études menées sur des sujets obèses rapportent l’intérêt potentiel d’une supplémentation en Lactobacillus gasseri sur la réduction du poids, du tour de taille et de hanches, ainsi que sur la masse graisseuse viscérale (7-8). Certaines bactéries végétales, comme les souches Lactobacillus fermentum K7-Lb1, K8-Lb1 et K11-Lb3, ont également montré des effets prometteurs sur la régulation du poids corporel chez les sujets en situation de surcharge pondérale abdominale (notre synergie L. Gasseri & SlimBiotics® combine précisément ces 4 probiotiques en une seule formule) (9).

Précisons enfin que pour maintenir un bon équilibre intestinal global, il reste particulièrement intéressant de se tourner vers un probiotique multi-souches qui fournira un large éventail de bactéries « amies » (en associant 20 souches scientifiquement reconnues, Full Spectrum Probiotic s’adapte avec une efficacité remarquable à la variabilité interindividuelle des microbiotes) (14).